Platform verbetert de zuiverheid en reproduceerbaarheid van extracellulaire vesicle proteomics

Een groep onderzoekers van het VIB -Ident Center for Medical Biotechnology heeft een nieuw platform ontwikkeld om extracellulaire blaasjes (EV’s) te isoleren en te analyseren, nanosized deeltjes uitgescheiden door cellen en een rol spelen bij cellulaire communicatie en ziekteverwikkeling. Faever genoemd, de methode verhoogt de doorvoer van EV -verrijking en is aanzienlijk kostenefficiënter dan bestaande methoden. De studie is gepubliceerd in de Journal of extracellulaire blaasjes.

Extracellulaire blaasjes (EV’s) zijn kleine deeltjes die eiwitten, RNA en andere biomoleculen van hun oorsprongscel dragen. Ze hebben veel belofte voor diagnostiek en therapeutica, maar het isoleren ervan van complexe biofluïden bij hoge zuiverheid en doorvoer blijft een grote uitdaging. EV’s zijn ongelooflijk klein – tussen 30 en 150 nanometer in grootte.

Om deze kleine containers met boodschappers te vangen, moeten wetenschappers vertrouwen op verfijnde apparatuur zoals ultracentrifuges. Helaas zijn deze traditionele methoden van EV -verrijking tijdrovend en resource -intensief met relatief lage doorvoer.

Nu hebben onderzoekers in het laboratorium van prof. Kris Gevaert van het VIB -Ident Center for Medical Biotechnology een nieuwe methode voor evaluatie ontwikkeld. Voortbouwend op hun eerdere werk gepubliceerd in Moleculaire en cellulaire proteomica in januari 2025ze demonstreerden de effectiviteit van met filter begeupt extracellulaire blaasjesverrijking, of faever in het verrijken van EV’s van individuele monsters in een geminiaturiseerd en 96 -nuthoge doorvoerformaat.

Kostenefficiënt en snel

Het nieuwe platform belooft een veel sneller en betaalbaarder alternatief voor bestaande methoden voor het verrijken. Met behulp van 96 -well filterplaten maakt faever een veel hoger doorvoervolume mogelijk door parallelle verwerking van monsters in minder dan 2 uur.

Essentieel voor de faever -methode is het gebruik van tween -20, een mild en goedkoop wasmiddel toegevoegd tijdens eV -wasstappen. De opname ervan bleek van cruciaal belang voor het verbeteren van de zuiverheid van het EV -proteoom door het voorkomen van vervuiling van de filtermembranen die worden gebruikt om EV’s te vangen en door zwakke interacties tussen EV’s te breken en overvloedige eiwitten te verontreinigen.

Belangrijk is dat deze verbetering van de zuiverheid geen complexe chemie of dure reagentia vereist, waardoor de methode toegankelijk is voor zowel laboratoria als klinische onderzoeksinstellingen met behulp van standaard laboratoriumapparatuur.

Dr. Jarne Pauwels, eerste auteur van de studie, “we hebben gemerkt dat de toevoeging van hogere concentraties van tween -20 leidde tot een duidelijke vermindering van verontreinigende niet -EV -eiwitten en een significante toename van de identificatie van transmembraaneiwitten, een belangrijke metriek in onze studies.”

Clinici een faever doen

Deze innovatie maakt de weg vrij voor meer reproduceerbare EV -gebaseerde proteomica en versterkt de basis voor toekomstige klinische toepassingen van EV’s in diagnostiek.

“We hopen dat deze nieuwe aanpak zijn weg kan vinden naar de klinische praktijk”, voegt Prof. Gevaert, directeur van het VIB -Ident Center for Medical Biotechnology toe. “Faever verlaagt de barrière voor EV -verrijking en biedt een aanzienlijk snellere en veel meer kostenefficiënte aanpak voor het analyseren van plasma- of urinebiopsieën voor biomarkers. We hopen dat deze nieuwe technologie kan bijdragen aan snellere diagnoses voor patiënten.”

De methode wordt al toegepast in samenwerkingen gericht op prostaatkanker, waarbij verrijkte EV -analyse kan helpen bij het identificeren van ziektespecifieke eiwithandtekeningen uit een eenvoudig urinemonster.